Aunque los trenes de larga distancia son bastante fiables (especialmente el galardonado GNER a Londres, Aberdeen e Inverness), los servicios domésticos de First Scotrail sufren constantes retrasos y cancelaciones, especialmente en la ruta Edimburgo-Glasgow.  La empresa ferroviaria principal, que sirve las rutas hasta/desde Inglaterra es Great North East Railway- GNER (tel: (0845) 722 5225; página web: http://www.gner.co.uk/), mientras que First Scotrail (tel: (0845) 755 0033; página web: http://www.firstscotrail.com/) opera todos los servicios de trenes dentro de Escocia, así como el servicio nocturno de Londres a Edimburgo.  National Rail Enquiries (tel: (0845) 748 4950) proporciona información sobre horarios y tarifas durante las 24 horas del día. 

Edimburgo tiene dos estaciones de tren- Waverley Station (situada en el centro de la ciudad, en Princess Street) y Haymarket Station (en el cruce de Dalry Road con Haymarket, en el West End).  Waverley tiene puestos de comida, una tienda de prensa y un pub.  Hay también otras estaciones, más pequeñas, en Newcraighall, South Gyle y en el Nuevo Edinburgh Park. 

Servicios de tren: First Scotrail (véase arriba) opera un servicio de tren desde Glasgow a Edimburgo cada 15 minutos (duración del trayecto- 50 minutos).  El Caledonian Sleeper es el servicio nocturno entre Londres (Euston) y Edimburgo, que sale cada noche excepto los sábados (duración del trayecto- 6 horas y 45 minutos).  Virgin Trains (tel: (0845) 722 2333; página web: http://www.virgintrains.co.uk/) opera un servicio directo entre Manchester y Edimburgo, tres veces al día (duración del trayecto- 3 horas).  GNER opera un servicio directo cada media hora entre Londres (Kings Cross) y Edimburgo (duración del trayecto- 4 horas y 30 minutos). 

Transporte hacia la ciudad: Tanto la Waverley Station como la Haymarket Station están a poca distancia a pie del casco antiguo y de la parte nueva de la ciudad.  Hay gran número de autobuses y taxis que sirven a las estaciones.